عقد مجلس جامعة الإسكندرية جلسة طارئة يوم الخميس الموافق 7 ديسمبر 2017 للنظر في قرار الرئيس الأمريكي دونالد ترامب بإعتراف أمريكا بالقدس المحتلة عاصمة لإسرائيل ونقل السفارة الأمريكية إليها . 
ومجلس الجامعة إذ يستنكر هذا القرار بشدة فإنه يعتبره سابقة خطيرة تنذر بحقبة جديدة من الصراع في منطقة الشرق الأوسط ، وبتداعيات غير محسوبه لهذا القرار المفاجيء والذي يعد مخالفاً لكل القرارات الشرعية الخاصة بالوضع القانوني لمدينة القدس ويتجاهل المكانة الدينية التاريخية الخاصة التي تمثلها هذه المدينة في وجدان الشعوب العربية والإسلامية . 
إن جامعة الإسكندرية التي كانت وستظل دوماً مساندة للحق العربي من خلال رسالتها الوطنية التي عرفت بها منذ إنشائها وحتي اليوم تؤكد مرة أخري إستنكارها اللامحدود لقرار الرئيس الأمريكي ، وترفض أية آثار مترتبة عليها ، كما تؤكد أن مثل هذه القرارات العنترية أحادية الجانب تخالف القرارات الشرعية الدولية التي تطالب جميعها بإحترام الوضع القائم تاريخياً في مدينة القدس حيث مسري الأنبياء ومهوي أفئدة المسلمين في مشارق الأرض ومغاربها ، كما أن هذه القرارات تعد تقويضاً متعمداً لكل الجهود التي بذلت لإحلال السلام في المنطقة ، بل وتشجع فلول الإرهاب فيها وتحول الصراع بين العرب وإسرائيل إلي حرب دينية لن تُبقي ولن تنذر ، بل وتكافأ إسرائيل وهي دولة الإحتلال علي إحتلالها للقدس وبقية فلسطين ذلك لأن مدينة القدس كانت وستظل مدينة عربية إسلامية ومسيحية وستكون عاصمة الدولة الفلسطينية المستقلة بإذن الله ، كما أن مجلس الجامعة يؤيد تأكيد الرئيس عبد الفتاح السيسي رئيس الجمهورية علي ضرورة الإلتزام بالمرجعيات الدولية وقرارات الأمم المتحدة في إطار السعي إلي التوصل إلي تسوية نهائية وعادلة في القضية الفلسطينية حتي يعم السلام في الشرق الأوسط وتنعم شعوبه بالأمن والإستقرار والتنمية.