حصل الجهاز الإدارى للجامعة على شهادة الأيزو الدولية9001/2008 ISO ، فى 21 مايو 2015 وذلك بعد قيام الإدارة العامة للجامعة بتطبيق وتحقيق متطلبات نظام الجودة القياسي طبقا للمواصفة الدولية وتم منح الشهادة من شركة TÜV Rhienlandالألمانية المانحة لشهادة الأيزو الدولية بعد إثبات القدرة على توفير المتطلبات اللازمة للأيزو والمواصفات القياسية الدولية لنظام إدارة الجودة وتطبيقها على الجهاز الادارى للجامعة وفقآ لدليل تطبيق معايير الأيزو الدولية على  المنظمات والمؤسسات  التعليمية وغير التعليمية وذلك بعد حصول الجامعة على مشروع "تطوير الجهاز الإدارى لجامعة الإسكندرية للحصول على شهادة الايزو 9001/2008" والذى بدأ فى 5/3/2014 حيث تم التطوير على خمس مراحل، شملت مرحلة دراسة وتحليل الفجوات، ومرحلة التدريب ونشر الوعي، ومرحلة تصميم وإعداد الوثائق لنظام الجودة، ومرحلة تجهيز الجهاز الادارى، ثم مرحلة التطبيق والمحاكاة من خلال الزيارات الميدانية وتقاريرالمراجعات بمساعدة إحدى الشركات المصرية المتخصصة وتحتإشراف إدارة الجامعة ومركز ضمان الجودة.